省昆虫研究所毒理昆虫学专业研究生谭景天无意中卷入一桩离奇的案件，死因竟与一种罕见的虫子——子弹蚁有直接的关系。 谭景天为洗脱“罪名”协助警察破案，并因此与年轻女法医金灵产生交集。谭景天在昆虫专业上的造诣和金灵精准的法医分析相得益彰，配合刑警队长陈悍及诸位刑警共同寻踪出每个案件的草蛇灰线。谭景天与金灵以及刑警队诸位警察一起完成了“美洲大蠊案”、“微刺盲蝽案”、“磕头虫案”、“多眼灰蝶案”、“梭毒隐翅虫案”等案件的破解。在此过程中，谭景天也解开了自己的身世之谜，揪出了隐藏多年的幕后真凶。
2002年一个举家团圆的中秋夜晚，肖兰兰、韩彩凤、张晓梅三家人聚集张晓梅自然清新的乡下老家在为五年前同一产房出生的三个孩子过生日。热闹喜庆的生日宴正要开始。在外玩耍的三个孩子，就象人间蒸发一样没了踪影。几个大人从喜悦祥和的气氛里遭受到了巨大打击，顿时陷入了灭顶之灾。孩子的集体失踪，给三个家庭带来了颠覆性的灾难。
在20世纪90年代中期我国陆军狼牙特战基地。大队长（侯勇 饰）向孤狼特别突击队员交代一项任务，是收回坠落在我国边境上的一枚卫星残骸。在我边境内孤狼队员们和寻找我国卫星的境外敌人交上了火，无奈境外敌军退出我国境内。孤狼们很快找到了卫星残骸，不料境外敌军也随后跟来，这时还是联络不上狼穴，猎鹰(吴京 饰）)击中一名敌军阻击手，天雷（周慧林 饰）跑去查看，假死的敌人炸伤了天雷的腿，猎鹰为了掩护天雷被敌军射中应声倒下。 十几年后，猎鹰何卫东的儿子何晨光(吴京 饰）作为一名全国青少年武术冠军继承父业参军入伍。和他一起入伍的还有跟自己不打不相识的街头混混王艳兵（徐佳 饰），朴实的农村小伙李二牛（赵荀 饰）。3人经过重重考验变成了名列前茅的好兄弟，但是要成为优秀的特种兵，前方的路还很长。
