本剧是一部描写现代家庭情感的电视剧，导演和主创人员皆为电视剧《红蜘蛛》的原班人马。每两集一个故事，通过对十个具有典型性的“问题家庭”的案例分析，向人们提出警示—该以怎样的态度面对家庭矛盾，以维持家庭的圆满，避免悲剧的发生，促进社会的安定团结。剧中通过十个家庭案件，揭示出个人内心的虚弱，描绘了人们由于情感错位引起的犯罪。导演将通过“情感十戒”向观众警示：每个人都应保持对生存的警戒，坚守生存规范。 该剧延续了《红蜘蛛》的纪实风格，并且加强了整体的艺术性。都晓介绍说，《家庭档案》不完全是纪实，但故事却力求真实，贴近老百姓的生活。为此，在演员的选择上剧组拒绝大腕加盟，选用一些实力很强的演员，除了史可、李婷、刘冠军等几位观众熟悉的演员外，大多数演员都是新面孔。
同欣药业是丹城市一家极有影响的民营企业。企业领导童欣和童钢姐弟经过多年努力，终于研制出一种以中草药为主要原料的抗癌新药，并得到国家有关方面高度重视，开始进入临床实验的关键阶段。 然而，有人却在暗中打这个新药的主意，那就是辰宇制药的老板萧震南。他企图把童氏新药的配方搞到手，卖给国外一个黑社会性质的商社，以摆脱自己濒临破产的绝境。本剧一开头，他已重金收买了一个叫斯军的人去卧底，但由于童氏企业管理甚严，斯军尽管深受重用，最终仍是形迹败露，失事身亡。 萧震南在国外那个黑社会性质的商社逼迫下，不得不让刚从某著名医学院研究生毕业的女儿萧弱语打入同欣药业充当商业间谍。 但萧弱语几经波折也未能通过正常途径进入这家公司。肖震南便精心设计了一次“邂逅”，让肖弱语成了童钢的救命恩人。不出肖震南所料，肖弱语开朗活泼的性格和对药物学的深厚修养终于打动了童刚。童钢不仅把她招进同...
初试身手，雷鸣警探遭遇第一案，痴情怨女巧施连环计，女毒贩浴室命案故布疑阵，警探雷鸣顺藤捉瓜智擒幕后毒枭。笃信基督的退休女教师康亚馨在骚扰电话中听到了基督教葬礼的致词，悉心照料她的女学生，却原是她远在他乡儿子的未婚妻，无微不至的关怀背后带来的竟是死神的请柬。身处婚姻危机之中的唐一鸣见到自己公司的员工奚雄之妹后，对她一见钟情。为了摆脱红杏出墙的妻子，唐与奚兄妹合谋杀害了她。新婚的丈夫出差南方期间却溺毙在本市的泳池内，百米外的树丛中有其寻欢作乐的痕迹。夏紫薇得知消息后难以置信。疑凶不久即落网。本案似乎可告结束，但雷鸣探长又发现惊人线索。盘山公路上发现一具女尸，车祸假象的背后引出一段杀人抛尸的命案，探长雷鸣此时却因伤住院，但他运畴帷幄，遥控指挥，侦破期间，命案一再发生，线索一再中断，悬疑诡异的案情中，探长雷鸣机智寻找着破译真相的密码。
临近新年，海舟市老牌商场罗百百货突然发生沉降事故，致使13人被困地下。这场时间与生命的赛跑，带来的是人性、道德与信仰的重重考验……
