影片讲述了为守护流落民间的忠良之女邱莫言及其手中的明朝海防图，龙门客栈老板娘金镶玉（娄艺潇饰）与江湖侠客周淮安（梁森饰）结缘，二人联手与神秘而强大的倭寇傀儡师（陈志朋饰）和前来追缉的东厂势力上演了一场尔虞我诈的江湖纷争。各方势力你方唱罢我登场，在龙门客栈的诡异龙船上搅动风云，在如此险局之中，金镶玉与周淮安之间既有并肩作战的江湖豪情，又有坚定的家国大义，其中情怀让人动容。此次，影片重新诠释经典故事，二人的感情将迎来怎样的结局，龙门客栈最终归处在何方，悬念迭起静待观众来揭晓。
A village on the Georgian Black Sea is full of friendly people convinced they know each other. One day, Eliko is found hanged. His granddaughter Moe comes to organize his funeral. She is confronted with a web of lies and the tragic consequences of Eliko’s hidden love life with Amnon, which lasted 22 years. The truth however frees Moe’s capability to love and forces the villager...
1970年代后期，长江某客轮。一批电影厂演员的到来，扰乱了“朝云”号客轮的平静。正在恋爱中的吴素琴（高英 饰）通过接触发现了杨英（吴海燕 饰）、张恋水（何麟 饰）之间一段鲜为人知的故事。十几年前，杨、张二人同在运河学校学习，久而久之，张对杨产生感情，欲吐又止。因为杨英心中藏着一个不为人知的密秘，那就是哥哥杨明（丁嘉元 饰）。张恋水不知内情，当见到杨明来看望妹妹时，他向杨明倾吐了对杨英的爱慕之意。但杨明的道白却大出张恋水意料之外，原来杨明与杨英并不是真正的兄妹，杨英幼年时家中遇难，是杨明的父亲（申怀琪 饰）救了年仅两岁的杨英，从此相依为命，成年后，杨英深爱上杨明。不久后，杨明在一次搬移航标灯时不幸殉难，杨英陷入悲苦之中......
本篇故事承接前作《格桑花开的时候》，江若婷（郑岚 饰）作为老师责任越来越重，面临的考验也越发升级。她不仅遇到老司机（修睿 饰）的不断骚扰，还有金主爸爸（赵亮 饰）提出的两难选择，老顽童郭爷爷（马德华 饰）的多次整蛊，笨贼（李昆鹰 饰）对善款的虎视眈眈……象征幸福的格桑花能否陪伴江老师度过重重难关呢？
