全てを錆びつかせる≪錆び風≫が吹き荒れる日本。 人々は街や生命を蝕む錆に怯えながら暮らしていた。 忌み嫌われる≪キノコ守り≫の一族の少年・赤星ビスコは、瀕死の師匠を救うため、 全ての錆を浄化する霊薬キノコ≪錆喰い≫を求めて旅をしていた。 旅の途中、忌浜（いみはま）で出会った美貌の少年医師・猫柳ミロもまた、大切な姉を蝕む錆の対処法を探していた。 愛する者を救うべく、ふたりの少年が手を取る時、新たな冒険が始まる。
ブシロードのトレーディングカードゲーム「カードファイト!! ヴァンガード」を原作とするテレビアニメ・シリーズの第五期。第四期で一区切りを迎えた物語からは大半の登場人物が入れ替わり、主人公の新導クロノを中心とする新たな物語へと突入する。本作から梅本唯が新たに監督を務め、シリーズ構成は「ラストエグザイル -銀翼のファム-」「悪魔のリドル」の吉村清子にバトンタッチされた。キャラクターデザインは引き続き、とみながまりが担当している。 ある日、中学生の新導クロノは下駄箱に謎のカードの束と一枚の地図が置かれているのを発見する。それは“ヴァンガード”というカードゲームのものであり、“ギアクロニクル”と呼ばれる誰も見た事のない幻のカードだった。“ヴァンガード”の世界を知り、綺場シオンや安城トコハとの出会いを経て、クロノの運命は大きく動き始める。
耗日持久的战争结束了，大地虽然满目疮痍，但总算迎来了短暂的平静，一片苍白的静默之中，地球进入了“衰退期”，历史的车轮倒转，整个世界停摆了。童年时代，深空彼方（金元寿子 配音）曾在一片废墟之中邂逅了一位神秘的女子，女子用手中的小号吹奏了《奇异恩典》，被美妙音乐吸引的彼方开始对小号发生了兴趣。 长大后，彼方加入了军队，被编入1121小队，在那里，她成为了一名通信兵。外表刚强内心柔软的和宫梨旺（小林优 配音）、个性傲娇不会轻易低头的墨埜谷暮羽（喜多村英梨 配音）、冷漠的天才少女寒凪乃绘留（悠木碧 配音）、成熟稳重的费利西娅（远藤绫 配音），在军中，彼方结识了这些个性迥异的好友，充满了快乐的日常就此展开。
原本还算有着可爱的脸蛋，可是不知为何总给人一种阴冷诡异不好接近的感觉。这便是刚刚升入高中不久的黑木智子（橘田いずみ 配音），她蓬头垢面，少言寡语，脸上是极度痴迷游戏后留下的黑眼圈。原本以为自己会成为乙女游戏中众星捧月的校花，谁知却注定要成为没有朋友、无人关注的丧女。更无法忍受的，是初中与之同类型的死党成濑优（花澤香菜 配音）都有了翻天覆地的变化。当然，拥有强大内心的智子绝不会因此自甘沉沦，她暗自嘲笑同学的肤浅与轻浮，在妄想世界里体会着前所未有的快乐。只不过依旧耐不住寂寞，这又化作了自卑、嫉妒和各种恶毒的心语。实在逼到极点，便朝向弟弟智贵（中村悠一 配音）。总之，她之所以变成这样，都怪这个世界和周围人而已…… 本片根据谷川ニコ的同名漫画改编。
