神州浩土，万物有灵，与精灵结成伙伴的天才被称为御灵师。被封印百年的少年石大力意外遇到了来自平行世界的御灵伙伴九尾天狐青青，踏上了成为首席御灵师、寻找自己身世之谜和守护世界的道路。
《灵境幻世》是拥有超高人气的虚拟现实游戏，其开发者卢危达来自未来。卢危达在未来世界因为诈骗罪而被通缉，他潜逃到现世，用他掌握的未来科技，先于历史开发出灵境空间技术，从而赚取巨额财富。卢危达的真正目的是让游戏中的怪物基美拉出现在现实世界中，最终统治世界。为了抓捕卢危达，来自未来世界的超时空护卫队派出了灵境巡逻员陆彩风。陆彩风发现大学生龙小峰是合适的人选。龙小峰经过刻苦特训，成长为了一名优秀的战士。与此同时，基美拉开始出现在现实世界，龙小峰的妹妹龙玲玲也受到了卢危达的控制。为了找回妹妹、保卫家园，龙小峰开始了讨伐游戏中穿越而来的各种怪物的艰巨挑战。
神王之子秦书身为神子，却天生凡体凡命，受尽天道界众人部夷厌弃甚至要被夺去神子身份，贬入凡间。直到他与主角相遇融为一体，开启万界签到系统，于混沌天绝云峰开启永动丹田。随后从神道界最底层走起，与修罗战、与鬼神斗、与武帝争，靠一己之力，斩尽神佛，独闯九九八十一重天顶，满天诸神都不能挡其路，以一介凡体走上神道之巅。最后从众多神子的生死决斗之中脱颖而出，独战九大帝子，破混元天尊夺取神道界的惊天密谋，成就新一代大帝。
三界皆惧的隐族尊主禾莞突袭天庭，上神南泽迎战，种玉小仙虞之瑶为保护南泽，舍命相救，与禾宛玉石俱焚之际意外重生，阴差阳错虞之瑶重生入了禾宛之体，重生后的禾宛隐之力大损，西海隐卫听昭前来帮助尊主禾宛恢复隐之力，之瑶自此被迫开启了双面女尊之路，人前佯装威严，君前娇俏可人……
