桃夭带着小和尚磨牙、第一季收服的小狐妖、桃都老邻居柳公子一起，为了寻找失踪的百妖谱而云游四方。在途中遇到应声、化蛇、媪姬、照海四个妖怪，为妖怪治疗各种疑难杂症。
本片讲述了一群兔子是怎么从种花家一穷二白的时候，通过自身的努力与奋斗，蹬了鹰酱一脸血，并且养殖出了自己的大蘑菇，发展成为蓝星最强五流氓之一的故事。本片故事纯属虚构，如有雷同，纯属巧合。本片漫画更新频繁，对于喜欢作者拖更的观众可能会稍感不适。
《阿优之兔智来了2》的故事延续《阿优之神奇萝卜》系列，故事讲述的是阿U和他的小伙伴们看守的那颗巨大的超级萝卜有天突然变小了，博士怀疑是巨石阵的土壤含有某种只对大萝卜有作用的特殊物质，而现在这些物质已经受到了破坏，大萝卜得不到营养开始萎缩。博士推测萝卜岛周围的岛屿上一定还有同样的土壤，可以让大萝卜恢复原状。孩子们主动要求承担这个寻找土壤的任务，为了帮助大家，博士送来一只名叫兔智的机器人，它不仅智慧超群，还拥有各种能力，在保护萝卜的过程中发挥了重要作用。但是兔菲依旧不放弃自己的梦想，他带领手下跳跳和甩耳开着飞行器一路跟随阿U他们，发誓要得到超级萝卜。
美丽的蔬菜园里，住着一群可爱的蔬菜精灵，然而在蔬菜园不远的地方，有一个贪吃府，里面住着青虫怪和它的忠实的仆人傻古古。青虫怪是一个科学怪人，他博揽群书，有自己的图书室和实验室，而且聪明贪婪诡计多端。青虫怪喜欢做一些奇怪的实验，经常研制一些神秘的药水，而且他是蔬菜精灵的天敌，最大的爱好就是吃蔬菜，所以一直对蔬菜园的蔬菜精灵们虎视眈眈，想独吞他们。青虫怪经常让自己的仆人傻古古偷偷潜进蔬菜园，得知蔬菜精灵们的行踪和近况，想方设法要吃掉这些可爱的蔬菜精灵。在傻古古提供蔬菜精灵们的情报之后，他总是想出各种办法来接近善良的蔬菜精灵，用各种诡计达到自己目的，但是蔬菜精灵们十分团结，在白菜精灵小翠的带领下大家一起对付青虫怪，一次又一次的挫败青虫怪的种种诡计和阴谋保护了自己和蔬菜园。
