神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
大林郡世家出身的林凡本是得到天骄令的绝世天才，却被未婚妻夺走武魂，沦为废物。当来历莫测的大魔寄生林凡身上，重新激活了他被废的武魂，使他成为稀有的双武魂体质，至此，林凡正式踏上崛起之路，从小小郡城，闯上诸天万界。
林幸一名平平无奇的普通人，一次回家途中受人买了一本“绝世好书”，当他满心期待翻开书目的时候，一阵眩晕，再睁眼的时候发现自己来到一个陌生新奇的世界，而他的人生也从此被改写......
故事围绕多个角色的情感纠葛与家族矛盾展开，主要情节包括宇浩与梦媛的童年回忆与情感冲突、刘奶与晴天的收留与矛盾、以及梦媛母为利益干涉子女关系等复杂人际关系。剧中包含大量家庭伦理、爱情和商战元素，人物关系错综复杂。
黑天易是一名警察，2014年因公殉职。两年后他的未婚妻袁晓佳不想待在这个充满回忆的城市，决定搬家离开，在收拾行李的时候找到了天易的一部旧手机。通过这个连SIM卡都没有的手机，晓佳却得以跨越时空，与天易再一次取得了联系……
