星星球的人们发现了一个新星球--古灵星，它是一颗神秘的星球，上面蕴含着各种神秘的资源。校长和博士率领五个超人去探险，他们无意中探入了古灵星的地下城，探秘失落的文明。灰心星球司令派大小怪在探险队卧底，随时窃取探险的成果，并带回灰心星球。超人们一边应付新环境，一边应付来自暗处的各种破坏。
大辰国帝后因意外互换了身份，原本两看生厌的人却因为互换体会到了彼此的难处。在互换的过程中，逐渐开始互相理解、互相信任。在边疆告急的危机关头，萧锦昀（实际为徐钰）为平定边境御驾亲征，最终凯旋而归。就在帝后二人克服万难顺利换回身体之后，鞑靼女王却突然入宫。与此同时，朝野之中，三王爷想要夺权的心思昭然若揭......
宅博士的父亲宅再佳在勇敢之城探索时失踪，现场唯一留下的一副斗兽棋，也在与反派的争夺中被打散，并幻化成八只棋兽，分散在勇敢之城各个大陆。为了知道斗兽棋中隐藏的秘密，从而找到宅再佳的下落，超人们踏上了收服斗兽棋之旅。随着超人们的进一步调查，他们发现事情远没自己想的那么简单，一个更大的阴谋正逐步浮出水面。
本季中邪恶的女王曼多拉将孔雀和罗丽抓回仙境，为救出同伴，各位主角将再次闯入仙境。女王控制的仙境更加危险，能否救出同伴我们还将拭目以待。本季中全新角色琪娜将会登场，她拥有神秘娃娃菲灵，并有着独特的战斗技能。她能否击败水王子和封银沙阻止邪恶女王的计划吗？
