本剧是1987～1992年香港亚洲电视公司根据正史与民间野史编写的剧集，动员了亚洲电视台的大部份艺员参与拍摄。该剧不但在香港造成了收视热潮，也在香港以外的地区受到相当程度的欢迎。剧名《满清十三皇朝》，源自民国八年（1919年）由“燕北老人”所著《满清十三皇朝秘史》。二者描写的俱为努尔哈赤建立的后金国与清朝共十二位皇帝。（包含十一代，同治帝和光绪帝为堂兄弟）。燕北老人因为皇太极（清太宗）将国号由“金”改“清”，年号亦由天聪改为崇德，算两个皇朝。故称之为“满清十三皇朝”。
故事发生在一间名为全心诊所的家庭式诊所里，齐芯（廖安丽 饰）、齐荃（米雪 饰）和齐彰（郭晋安 饰）三兄妹共同打理着这间诊所。齐彰是一名儿科医生，性格开朗善良的他深受孩子和家长们的信赖和喜爱，虽然在业界小有名气，但实际上，看着深受病魔折磨的孩子们痛苦的模样，齐彰自己也觉得非常难受，再加上齐芯和齐荃之间的关系并没有表面看起来的那么交好，每当两人产生矛盾时，总要齐彰出面来缓和，长此以往，齐彰的内心里积累了许多的压力。 齐荃一直想要当一名医生，但为了这个家庭考虑，她放弃了理想，成为了护士，而妹妹齐芯则顺利的成为了妇产科医生，这件事情成为了齐荃心里的一根刺，常常刺痛她。
李时珍（林文龙 饰）自由沉迷于草药研究之中，他同名为吴慕榕（李诗韵 饰）的女子先前已有婚约，却无法自持的爱上了善良美丽的阿冬（叶璇 饰）。李时珍决定将这份感情埋藏在心底，待科举考试之后向阿冬表白心意，哪知道在阴差阳错之中，他不仅没能够表白，还娶了吴慕榕为妻。 李时珍发现当今世上的医书错误连连漏洞百出，于是起了编撰《本草纲目》的念头。然而，他却因为个性过于耿直而得罪了权贵，使得他不得不暂时中断了医书的编撰，还性命不保踏上了逃亡的旅途。所幸有太医院的庞宪（马国明 饰）一路帮助扶持，李时珍终于完成了旷世奇作《本草纲目》。
花满楼为陆小凤好友，出身于医学世家，自幼因病盲目，但有着高超的武功，和异常敏锐的听觉与嗅觉。 绣花大盗屡犯奇案，京城为之轰动。陆小凤被友所激追查此案，花满楼助之，二人终查出绣花大盗乃名捕金九龄，满楼与之打斗时檀香剑客杀出，刺死金九龄灭口。 西方圣教入侵中土武林，派卧底到中原各大门派，陆小凤、花满楼、西门吹雪察觉，并助各门派铲除奸细，三人更组织中原众高手一同深入楼兰。期间，小凤对薛冰的痴缠不胜其烦，却爱上风尘女子晶晶；满楼亦暗恋晶晶，但知其心仪小凤后黯然退出。晶晶本为圣教圣女，但她因恋小凤而不欲争教主之位。冰祖母薛夫人为救小凤而亡，使冰对凤心死。 中原另有一神秘隐形人组织与圣教暗中较劲，金九龄与檀香剑客均为其旗下杀手。隐形组织偷去圣教圣物罗剎令，使玉罗刹教主地位不保，并引起教中内斗。小凤等几经艰苦到神秘岛探查，得知隐形人组织首领为流云居士，其武功高深莫...
面对一个个错综复杂的悬疑案件，法证部高级化验师余星柏（黄宗泽 饰）、重案组高级督察井浩然（袁伟豪 饰）、法医科高级医生范佩清（蔡洁 饰）三人团将如何一步步抽丝剥茧，在危机四伏的谜团中，用科学揭露事实寻觅真相？在面临生死时，他们又将如何坚守本心，完成对自我和他人的救赎？一切答案都将在本季剧集中揭晓。
善良单纯的花丽珠（佘诗曼 饰）只有十岁小孩的智商，自父母离世后，她就肩负照顾弟妹的重任，除了赚钱，她事事亲力亲为，保护弟妹更是刻不容缓，经常闹出不少趣事；而花家真正的话事人二家姐花丽萍（梁靖琪 饰）碍于丽珠是智障，弟弟花伟聪（林子善 饰）又不务正业，为求早日摆脱家庭担子，在工作上往往不择手段，甚至协助旧爱上司陆浩昌（敖嘉年 饰）出卖公司利益。一天，公司集团主席蒋森（胡枫饰）突然中风昏迷，一向玩世不恭的孙儿蒋奕（林峰 饰）被辞退所有职务，最后更沦落街头，幸得丽珠的照顾，二人日夕相对产生了微妙的感情，但当爷爷苏醒后坚决反对他们非一般的关系，迫使蒋奕放弃花家姐，重回现实世界，接受一般人所谓的正常生活和正常关系……
故事发生在清康熙年间。自幼孔武有力的聂多宝（马浚伟 饰）因与蓝翎侍卫尔豪发生冲突，引发满汉冲突，康熙（陈国邦 饰）为不使争端升级，下令汉人也可投考御前侍卫，后因孝庄（程可为 饰）太后阻挠而搁浅。顺治临终前留下书信一封，福全（马国明 饰）认为此信肯定牵扯到谁来继承皇位的问题，追查中得知信已遗失，于是他滥杀无辜，并将罪责全部推在孝庄、康熙等人身上，令头脑简单的多宝误入歧途。一个偶然机会，多宝听人谗言，说康熙是逼害自己家人的仇人，他想利用康熙南巡途中将其诛杀，但经过激烈的思想斗争最终没有下手，康熙念其护驾有功，升他为侍卫统领。此时，继位无望的福全终于发难了......
柔美（苏玉华 饰）是一个名不见经传的小演员，她的父亲高守（秦沛 饰）则是著名的日本料理店店长。在一次争吵之后，柔美毅然离开父亲远赴日本，打算靠自己的力量闯出一片天下。在日本，柔美和父亲店里的大厨礼和（陶大宇 饰）偶遇了一位失忆老人，通过制作充满了回忆味道的美食，礼和成功的唤起了老人对于妻子的记忆。 让柔美和礼和没有想到的是，老人原来是当地德高望重的著名美食家，这一段特殊的故事传回香港，媒体却误将对料理一窍不通的柔美当做了故事中的料理神手，柔美因此一夜成名。眼看着一直以来的梦想就要成真，柔美央求礼和帮她保守秘密，自己则摇身一变成为了一档美食节目的当家花旦，在欲望和利益的诱惑下，她越走越远。
谢颖的离开让张伟杰（梁朝伟 饰）深受打击，封闭起了内心，不愿意再结识新的伴侣。期间，叔父张竟成（周润发 饰）从大陆来到香港，叔侄两人之间建立起了深厚的友谊。一次偶然中，张伟杰认识了名为巧宣（曾华倩 饰）的女孩，巧宣的温柔和善良融化了张伟杰内心的坚冰，两人渐渐走到一起，最终携手步入了婚姻的殿堂。 然而，随着时间的推移，最初热切的激情慢慢冷却，久而久之，张伟杰竟然和巧宣的好友吴欣产生了一段不道德的恋情。在一宗谋杀案里，吴欣不幸的成为了受害者死于非命，这起案件将巧宣和张伟杰也牵扯了进去。
六十年代的香港，被喻为受着中西文化冲激的动荡年代，当时经济腾飞，贫富悬殊，在繁华背后。黑道横行。有人巧取豪夺，有人混水摸鱼，更有人无所事事，丁贵妹便是黑帮二世祖中的表表者，多年来未曾沾手江湖争斗，更懒理外面腥风血雨，只顾吃喝玩乐，风花说月，但好景不常，适逢叔父虾叔年事已高，而仅有的精力亦花在娶妾身上，根本无力再料理黑帮业务，故将生意推到丁贵妹身上，妹人到中年始从头学起，拉夫上阵，黑帮二世祖摇身一变为舞厅及麻雀馆老板。在大吹一夫一妻制度的风气下，生性风流的妹却一于少理，眼见舞厅美女如云，一心以为近水楼台手到拿来，更梦想步叔父后尘，三妻四妾左拥右抱，岂料身兼妇女会主席的老婆洛芙蓉眉精眼利，略施小计便顺利安排由大陆来港的弟弟洛枸杞随丈夫工作，既打理酒家与舞厅生意，更替妹处理球队事宜，目的只为监视妹一举一动慎防越轨，但蓉手上皇牌莫过于妹之高龄祖母李兰，只因兰生性刚烈，痛恨男人到处留情，更视一夫多妻为天地不容之事，稍有发现定必严打，令一向风流的妹吃尽苦头，故妹视兰犹如洪水猛兽又敬又怕不敢造次。 正当成年人忙于纠缠在复杂关系时，自幼受父母保护的丁明珠却暗暗起革命，原来珠一次机缘巧合下，认识由外国回来的高威利，眼见利被袭，以为被坏人所害，故挺身保护，因而展开一段既浪漫又刺激的男女关系，珠更为利那非比寻常的经历而着迷，暗生情愫，藉口以请补习老师为名招郎入舍，借妹之势力暗中保护利。不过妹与蓉不知就里，见珠受伤回来便以为有人对丁家不利，大为紧张。蓉知棉身手不凡，请棉为珠之保镳，妹反对不果，蓉反而乘机叫棉给妹贴身保护，以防妹再次风流。 自此棉犹如贴身膏药对妹寸步不离，妹不胜其烦加上屋契事件，令二人不时针锋相对彷如斗气冤家，但因棉处处表现强悍，不禁挑起妹征服之心，誓要将棉收服，另一方面，棉亦透过珠口中得知妹非自己想象般胡作非为，慢慢对妹改观，甚至有着不能言喻的好感，在妹苦苦痴缠下，未尝真正恋爱的棉心如鹿撞，不知如何是好！ 正当妹、蓉与棉的三角关系蕴酿的同时，珠与利却在不知不觉间发生感情，妹见珠对利有意，顿起醋意，更以己度人，认为天下男人皆好色，为免女儿被骗故扭尽六壬以试利为人，但反而发现利一段神秘往事。 当蓉忙于筹办婚礼时，妹却全力展开追求攻势，棉不敌妹苦苦痴缠向蓉求教，蓉不知苦缠棉正是自己丈夫，竟倾囊相授，二人自此发展微妙的师徒关系，但道高一尺，魔高一丈，妹最后仍将棉打动，更发生关系…。虽说米已成炊，但棉自觉愧对蓉，为不破坏人家幸褔，本想悄然引退，但妹苦苦痴缠要给棉名份，扬言要纳棉为妾。 与此同时，利协助妹进行纳妾计划，暗中大捞油水，而自己亦可藉机风流，利更提议妹奉旨去滚，迫使蓉接受棉为妾，但妹竟一滚忘形不能自拔，棉妒火中烧向妹大兴问罪，二人关系终告曝光，蓉知悉后大为震怒，二女双双与妹闹翻，妹齐人好梦顿成空。其后，妹发现利乃骗财骗色之小混混，本想向珠告发，但却给利先发制人，反指妹大话连篇，妹顿成众矢之的，虽惹蓉与棉讨厌，但二女仍各不相让，棉更要求名份嫁入妹门下，而蓉亦不甘示弱，再次与当年歌厅阔客来往，藉此刺激丈夫回头，其次更向虾叔告状求主持公道，虾叔老马有火，指妹拋妻弃女罪无可恕，男人可以风流但不能下流，故下令全面封杀，妹顿时一无所有，无钱无面，更无一技旁身，黑帮二世祖随即沦为落难中年，惨如过街老鼠，妹为求温饱，只好委身去妇女会工作，终令自问风流的妹反省过来，人彻大悟。
