越今朝和越祈二人在乌岩村相伴三年，有着神奇的“共鸣”关系，却对各自的身世一无所知。二人携手闯荡江湖，希望找回过往记忆。双越二人被卷入启魂圣宗作乱和洛家堡血祭等神秘事件之中，而在对抗圣宗过程中意外让越祈被封印的回忆和情感被开启。随着事件发展，双越结识了洛家堡双子洛埋名和洛昭言、千年狼妖闲卿、顾寒江和明绣师徒以及居十方等一众江湖人士，二人的真实身份也逐渐揭开。正武盟、启魂圣宗、衡道众、禺妖族，几大势力接踵而至，谁才是真正的幕后设局人？计中有计，局中有局，不惜舍身改命，只为今朝再聚。
本剧是一部描写现代家庭情感的电视剧，导演和主创人员皆为电视剧《红蜘蛛》的原班人马。每两集一个故事，通过对十个具有典型性的“问题家庭”的案例分析，向人们提出警示—该以怎样的态度面对家庭矛盾，以维持家庭的圆满，避免悲剧的发生，促进社会的安定团结。剧中通过十个家庭案件，揭示出个人内心的虚弱，描绘了人们由于情感错位引起的犯罪。导演将通过“情感十戒”向观众警示：每个人都应保持对生存的警戒，坚守生存规范。 该剧延续了《红蜘蛛》的纪实风格，并且加强了整体的艺术性。都晓介绍说，《家庭档案》不完全是纪实，但故事却力求真实，贴近老百姓的生活。为此，在演员的选择上剧组拒绝大腕加盟，选用一些实力很强的演员，除了史可、李婷、刘冠军等几位观众熟悉的演员外，大多数演员都是新面孔。
该剧主要讲述了在五洲之中的凛洲有一条名为素水的河，相传素水常常笼罩着不详的阴霾，乡间更有吃人的传言，但事实上，素水确实不简单，穿过去便是汲族的隐居之地。就在那样一个神秘的地方，一场飞廉将军与汲族灵女之间跨越山海的爱恋发生了——他们之间不仅隔着千年来五洲大陆对汲人的偏见与冤枉，也隔着一场以爱为名的豢养骗局。当他们面对真相，是否能抛开成见，找到破开死局的办法？
1939年初，日寇占领两广，留守坚持作战的东江纵队组建了一支城市行动队。这支部队它的战场不在高山和原野，而在光怪陆离的都市。行动队的队员们各个身怀绝技，本领不同。有出身日本军校，擅长各种枪械的队长祈中垒，绰号“中尉”；也有出身大户人家，擅长轻功手雷夺命飞刀的梅彦芳，绰号“一剪梅”；还有忠诚木讷，功夫了得的北方帅哥马振奎，绰号“拐子马”；另有擅长爆破，专治各种不服的的马振奎妹妹马兰兰，绰号“蓝凤凰”；以及风情万种、擅长信息刺探的雷秀梓，绰号“九岁红”和巧舌如簧、擅长化妆套取情报的刘相林，绰号“刘公子”。他们这个小组就行像古时的剑客，总是潜入敌人的心脏，给日寇以沉重的一击。 自从队长祁中垒巧妙布置，铲除了日本特高课下属组织黑龙会的会长龙田一后。激起了日本华南战区特高课最高指挥官竹内英雄的愤怒，他从日本本部招来自己的老部下北辰新作，对东江纵队的地下组织展开...
舞蹈家何丽（李颖 饰）抛弃了女儿丁小寒（陈乔恩 饰）和丈夫丁亦明（蒋恺 饰），只身一人来到英国深造，并且在那里生下了第二个女儿何菲（戴菲菲 饰）。在何菲十岁那年，何丽将她送回了国内的舞蹈学院上学，机缘巧合之下，何丽和妹妹丁小寒相识了。 何丽和丁小寒同时喜欢上了名叫杨睿（明道 饰）的男孩，面对两个同样娇俏可人的姑娘，杨睿不知道该如何选择。何菲成为了著名歌剧《图兰朵》中的女主角，然而在演出前期，她却因为胃疾复发而无缘舞台。作为她的替补，丁小寒获得了登上舞台的难能可贵的机会，然而，就在演出的最高潮，丁小寒的眼疾发作。
昌和二十四年，太祖驾崩引发继位之争。晏清殊遭人陷害被退婚，在家破人亡之际被萧景炎所救。二人结盟回京展开复仇，揭露了陵王和谢家等势力的谋逆罪行。在历经生死考验的过程中，两人互生情愫，最终携手破局查清阴谋，于乱世中重塑家国山河。
