《天使的眼睛第二季》这是一部青春涉案剧，主要是讲述了具有超异能的安小童与警察男友江一鸣，联手对抗邪恶博士的科幻故事。
这一世，唐少因为仓促转移到沈宸身上，忍受着巨大的排异痛苦，而比身体上的痛苦更让他难以忍受的是，安小童不仅承载了安琪的能力，还变成了安琪的模样，等了一百年的唐少开始无法分清小童和安琪。因此，唐少想要放弃一切，带着安小童离开。可安小童却在唐少苦苦挣扎等待的时候，先一步爱上了江一鸣。唐少为了小童，不惜将所有实验摧毁与江一鸣意识交换，霸占江一鸣的身体。你爱他，我就变成他的样子。
十年前，赵海洋与方程在追击一起灭门案的杀人凶手时，因赵海洋的异常举动引起歹徒警觉，导致了师傅夏辉的牺牲。十年后，赵海洋从一个普通警员成长为东州市公安局的副局长，方程则带着自己研发的技术成果回到东州市进行警务改革。二人相见并没有想象中的友好，赵海洋对方程充满了成见，同时对他带来的警务改革思想也充满了抵触。近年来，各种新型犯罪模式不仅让赵海洋应接不暇，更是让同样身为警察的妻子安萍被下放到派出所。束手无策之际，方程利用新的刑侦技术手段为赵海洋解决了众多难题。智能交通、合成侦查中心、网格化建设让犯罪分子无从遁形，反诈中心让诈骗分子无从下手，环食药支队建立，让老百姓吃的更放心。警务改革工作也如春风化雨一般逐步展开，初见成效。就在一切顺利进行的时候，十五年前的灭门案凶手浮出水面，赵海洋与方程联手誓将凶手缉拿归案，但是在侦查过程中，似乎总有一股强大的势力在阻挠着案...
