玉茗格格（李小冉 饰）深受父皇乾隆（许文广 饰）喜爱，她在宫里天不怕地不怕，只怕一种东西，那就是毛毛虫。玉茗无事在民间闲逛，结识了几个年龄相仿的伙伴。随着年龄增长，格格喜欢上了上官锦弘（卲峰 饰），但她做梦都想不到上官竟是她同父异母的哥哥，这是当年父皇一夜风流欠下的孽债，两人自不知情，兀自真诚相爱。乾隆得知宝贝女儿爱上了上官锦弘，龙颜大惊，设计将玉茗许配给和珅之子殷德（苗海忠 饰）为妻，遂向玉茗道出实情，玉茗闻言芳心俱焚，拉着上官跳崖殉情，不料殉情未果，玉茗成了疯子，上官则失去了记忆。不久，宫里传来流言蜚语，和珅之子殷德竟是乾隆的私生子......
《大清神捕》将背景设置在十九世纪中叶，鸦片战争后中国近代史正式拉开帷幕，时值清廷内忧外患，而此时的南方阳城，一起耸人听闻的剥皮案，更是引起各方势力的蠢蠢欲动。阳城县热血捕快白雪晴的查案之路被县长何玉庭阻拦，却意外和暗访的四阿哥发现人皮案的后面涉及到关系着大清命运的阎王宝藏，两人寻宝之路正式展开……
