远在人类文明15,000年前，地球上的高智能哥斯麽族就被两只大昆虫型怪物—摩斯拉及巴特拉所摧毁。而在一次山崩後，现今日本的伊房岛上却将埋藏在地下的摩斯拉巨蛋发掘来。其後三只史上最强大的怪兽—哥斯拉、摩斯拉及巴特拉碰头对决，虽然大怪兽摩斯拉及巴特拉联手成功将哥斯拉封印在海中，但人类的危机却并未解决，因为一颗超巨大的陨石将撞向地球…

　　自从摇滚的梦想被击碎后，铃木良一（长谷川博己 饰）便委身一家乐器公司浑噩度日。他唯唯诺诺，几乎成为全公司所有人欺凌和嘲笑的对象。在这些人当中，只有同样有着孤独感的寺岛裕子（麻生久美子 饰）向他投来同情的目光。某天，良一买了一只小乌龟，他在房间内对小乌龟倾吐着自己种种难以实现的梦想。然而在遭到同时的嘲讽后，他一气之下把乌龟扔进了马桶。乌龟顺着下水道来到一个神秘所在，衣衫褴褛的老人（西田敏行 饰）拥有神奇的糖果，可以让被遗弃的玩具和动物开口说话，而小乌龟则不小心吃了能实现梦想的糖果。它念念不忘良一的梦想，而随着梦想实现，小乌龟的身体也越来越大。
　　良一的命运发生转变，他朝着未竟的摇滚之梦再度进发……

　　最强战士贝利奥斯因为渴望人工太阳火炬的力量而坠入黑暗，但他的叛乱最终被奥特之王平定，并被打进宇宙监狱……
　　多年以后，被扎布拉星人救出的贝利奥斯重回光之国，打败了众奥特战士，成功夺走人工太阳火炬并到怪兽墓场去。失去了火炬的奥特之星瞬间冻结，成功逃离的就只有梦比优斯、初代和赛文。
　　此时，盘龙号在特顿星遭遇怪兽的袭击。在雷将怪兽消灭后，梦比优斯把雷带走，并向他求救。两人与初代、塞文会合后，便一同前往怪兽墓场……其后，盘龙号再次遭受怪兽袭击，而此次被戴拿出手相救。在杰顿星人口中得知奥特之星的灾难后，盘龙号也飞往怪兽墓场……
　　另一方面，在K76行星接受雷欧兄弟特训的赛文之子·ZERO在听闻奥特之星的危机后，也动身到怪兽墓场……

2002年的夏天，北海道大学撞击坑形貌学研究生水泽惠（竹内结子 饰）毕业在即，她听取了宇宙科学研究所对外协力室室长的场泰弘（西田敏行 饰）关于外太空卫星的演讲后分外兴奋，而她的见解与学识也引起了的场的注意。此后不久，水泽受到的场邀请前往研究所实习。此时以坂上健一（高岛政宏 饰）率领的日本航天团队正集中进行小型探测器MUSES-C的研发，他们计划将探测器发射到想当于往返地球和太阳之间距离以外的一颗小行星采集样本，这项看似简单的任务面前有着难以想象和逾越的困难。经过团队以及相关人员的通力合作，命名“隼鸟号”的发射器终于迎来发射的日子…… 　　本片根据日本航天的真实事件改编，由20世纪福克斯、东映、松竹各自拍了3个版本的电影。本片为20世纪福克斯拍摄。

　　1992年，一架飞碟突然出现日本上空。飞碟走下三名自称时来自23世纪地球联邦机构的官员，他们要求直接与日本首脑对话，敦促日本尽快消灭哥斯拉，防止重蹈未来亡国的命运。
　　专事研究各种神秘事件的寺泽健一郎（丰原功补 饰）在未来写过《哥斯拉诞生》一书，其中披露了这只恐怖怪兽诞生的秘密。根据这本书的记载，未来人提出要健一郎、曾在太平洋战争期间目击哥斯拉的恐龙专家真崎洋典（佐佐木胜彦 饰）以及国家超科学研究中心成员三枝未希（小高惠美 饰）乘坐时光机返回1944年的拉哥斯小岛，试图将哥斯拉传送到别的地方。
　　寺泽他们的行动取得成功，但是20世纪却出现了另一头怪兽三头金龙王。种种诡异事件的背后，可怕的危机遽然降临……

未来世界，秘密系统“白金数据”得到开发，日本全国人民的DNA数据被存储其中，进而借此构建了一个检举率100%、冤案率0%的理想社会。可即便如此尖端的系统，也被代号为“NF13”的连环杀人案所难住，凶手犯案累累，且至今下落不明，甚至连“白金数据”的开发者蓼科兄妹也惨遭杀害。此后不久，特殊解析研究所的天才科学家神乐龙平（二宫和也 饰）对蓼科早树（水原希子 饰）尸体上提取的嫌疑人基因进行解析，竟发现真凶的矛头指向自己。凭借同事白鸟理沙（杏 饰）的帮助，神乐连忙逃脱，而以刑警浅间玲司（丰川悦司 饰）为代表的搜查一课早已在这座城市内部下天罗地网。在此过程中，神乐自身的秘密逐渐付出水面，真相更是出乎所有人意料…… 　　本片根据著名推理小说作家东野圭吾的同名原作改编。

　　卡美拉与卡欧斯决战后的冬天，北海道降下流星雨，其中一颗坠落在支笏湖南西方约一公里处，陆上自卫队第11师团随即派出化学防护小队，渡良瀬佑介二佐与花谷陆尉深入调查，发现到了是陨石坠落。
　　五天后，事件的原凶开始现身，札幌市地下铁的电车在隧道内被不明生物攻击，北海道札幌市的薄野出现巨大植物，巨大植物窜出一群体长3m，类似昆虫的甲壳类生物。
　　怪虫(Legion)与植物是与流星一起飞来的地球外物体，两者属共生关系，Legion会借由啃食硅酮并分泌氧气来制造植物(草体)，在这种高浓度氧的环境下，地球生物绝对无法生存，自卫队决定用爆破处理草体。此时海上自卫队探测到卡美拉往札幌飞去........