成康十一年，戍守边关八年的定北王江绪，为调查定北军军饷被贪墨一案回到大显朝。岂料贪墨案背后牵连甚广，为了尽快查明幕后真凶，肃清朝堂，江绪自愿迎娶同为将门之后的明檀，让明家免遭利用。随着阴谋被逐渐揭开，江绪发现凶手的贪墨之举关乎整个大显朝的经济命脉，他必须釜底抽薪将朝中所有与之相关者连根拔起。谁知明家因江绪彻查之举遭了诬陷，家破人亡。江绪为明家力证清白，经历坎坷变故的二人萌生出真情实意，二人携手同行，决心要彻底瓦解敌方势力。他们查明了真相，终将凶手绳之于法，保卫百姓安全，同时也收获了爱情。
本剧是一部描写现代家庭情感的电视剧，导演和主创人员皆为电视剧《红蜘蛛》的原班人马。每两集一个故事，通过对十个具有典型性的“问题家庭”的案例分析，向人们提出警示—该以怎样的态度面对家庭矛盾，以维持家庭的圆满，避免悲剧的发生，促进社会的安定团结。剧中通过十个家庭案件，揭示出个人内心的虚弱，描绘了人们由于情感错位引起的犯罪。导演将通过“情感十戒”向观众警示：每个人都应保持对生存的警戒，坚守生存规范。 该剧延续了《红蜘蛛》的纪实风格，并且加强了整体的艺术性。都晓介绍说，《家庭档案》不完全是纪实，但故事却力求真实，贴近老百姓的生活。为此，在演员的选择上剧组拒绝大腕加盟，选用一些实力很强的演员，除了史可、李婷、刘冠军等几位观众熟悉的演员外，大多数演员都是新面孔。
该剧根据墨书白小说《长公主》改编。故事中，大夏朝的长公主李蓉（赵今麦 饰）与当朝首辅裴文宣（张凌赫 饰）梦回华年，由仇人变闺蜜，闺蜜变成有情人。他们彼此信赖，彼此成全，终于破镜重圆，一起搞事业，一起发现真相，一起发现爱。
