该剧改编自步月浅妆的小说《权宠之仵作医妃》，讲述大理寺卿沈毅因卷入晋王案，全家惨遭灭门，其女沈莞借用秦府九娘子秦莞的身份逃到荆州。原本柔弱可欺的秦莞“性情大变”，不仅会治病救人，还能剖尸探案，顺带将秦府的伯母庶妹姨娘刁奴治得服服帖帖。探案期间秦结识了睿王世子燕迟，燕迟一心为晋王翻案，与秦莞为父昭雪的目标不谋而合，二人一起回京，途中联手破获了各式诡谲大案。回京后，一具意外发现的骸骨让晋王案得以重提，燕迟和秦莞一起慢慢接近了案件的真相，发现了皇宫里深藏的惊天秘密。
京城突然出现成群的飞虫伤人事件，令百姓人心惶惶，一时间家家夜间闭户不敢外出，苦不堪言。朝廷责六扇门处理飞虫伤人案，限期一个月。此事落在了六扇门名声最响的捕头何越非的头上，而胸怀正义的丁昭昭也很想参与查案，亦只能私下展开行动。丁昭昭一个人独自去树林探求飞虫的真相，不料差点受伤，还好被及时赶来的楚不凡营救。楚不凡利用自己人脉极其广泛的优势与何越非谈判，让其同意丁昭昭一起查案，势在助力其尽快结案。三人发现道士李子风利用此事赚钱，甚是可疑。变装偷走了道士的解药，在寻求医者的帮助下偶遇了与温思行极其神似的游医魏紫，四人在组队查案的过程中，发现竟是一场蓄谋已久的复仇
1977年冬，青梅竹马的春雪和麦茬相约一起参加高考。考试前夕春雪家中突遭变故，不得已嫁给了金沙窝村的青松。麦茬一气之下离家出走。麦茬的父亲魏守根为了证明自己的身份，一直在寻找当年的部队。春雪婚后遭遇家庭暴力，提出离婚，通过招工进入县里的服装厂，却因流言被厂里开除，走投无路之时被幼时的伙伴条子所救，回村成立了自己的缝纫社，重燃对生活的渴望。在外闯荡的麦茬学到了一手烧砖技术，在县委栗书记的鼓励下，回到家乡搞活了村里废弃的砖窑。在春雪和麦茬的带领下，贫穷的小山村成了省里经济发展示范村。魏守根找到了自己的部队，春雪也渐渐对麦茬重新打开了心扉。进入新世纪后，砖窑和服装厂被关停，春雪的儿子天明毕业回村，意识到土地和粮食才是农民的根，带领村民发展种植绿色粮食蔬菜，成功进行产业转型。
