神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
苍云界，仙魔两道相争不断。 徐长青出身青莲剑谷，一心想当剑仙，好景不长，苍月宫第九魔将入侵青莲剑谷，徐长青爷爷牺牲，徐长青获得“青莲帝剑”的认可，与第九魔将对抗不敌。后昆仑太白剑仙秋无涯赶到，击退魔门，将徐长青和牧紫熏带至昆仑。昆仑众真人想夺青莲帝剑，被秋无涯呵止。徐长青觉醒了自己的仙灵“混沌聚灵碑”，被秋无涯收作弟子。在仙剑大比中，徐长青击败夏青候夺得头冠，获得进入昆仑禁地的资格，为了找到能够复活爷爷的不老神泉，徐长青选择踏入凶险的昆仑禁地。
蛰伏三年，林寒觉醒御兽系统，收获十个超凶兽娘！开启无敌模式逆袭，一不小心被兽娘们逼成全球战力巅峰！
地球能源枯竭，林一为改变命运，参加《灵神大陆》游戏内测，却因系统故障丧失记忆，受困游戏，在与奸商系统蛤蟆白驹的讨价还价中，林一多了个极其凶残的外挂，莫名其妙踏上修炼路，唯一美中不足的，是这系统有点费灵石。 修炼进度太慢？功法不够给力？武器威力太小？简单，只要灵石管够，任何问题都能解决！ 就这样，林一靠着逆天的系统加持，一路势如破竹地碾压，数度危难，救下神秘少女墨白雪，勘破盔甲士兵的万军阵，击败凝练出寒玉的巨大boss—守墓兽，通过心魔考验……这片大陆看似祥和，实则危机四伏，林一更在险难中结识了死皮赖脸要当他小弟的周不正、和不打不相识的冰块脸季云宇，还以两只烤鸡拜得高深莫测的神秘老头上官鸿为师，前路漫漫，在林一靠着系统纵横四海所向披靡时，却被美貌御姐吴恬绑架，深入地下墓陵探险……
在一个架空世界里，有一小群秘密存在着的“特殊能力者”，简称特能人。他们不会在普通人面前暴露自己，并通过一个自治组织——异控局，对各种特能造成的非自然事件进行管理，维护社会秩序。然而随着时间推移，特能人之间也出现了立场分化。有人想要守护和平维持平衡，有人想利用特能攫取私利。矛盾，一触即发。
兽王争锋冠军争霸赛，只有获得兽王争锋冠军的战队才有资格参加的最高级别赛事，崭新的舞台，全新的规则，新奇的精灵，以及未知的神秘力量——原石之力。在资格赛中获得参赛资格的GOGO战队，将挑战这个全新的赛事，并立志获得冠军争霸赛的第一名，成为名副其实的最强战队。随着比赛的进行，对新规则和新精灵一无所知的GOGO战队，渐渐掌握了规则，提升了各自的能力，越战越勇，并为此四处寻找神秘的原石，战胜了一支又一支冠军战队。同时，参加比赛的战队中有一支面具战队，他们的实力极强，手段凶残，始终给泰羽一种不舒服又熟悉的感觉，当泰羽发现面具战队的天劫正在利用全新的混世精灵收集黑暗力量，并企图用黑暗力量统治地球时，泰羽以及GOGO战队决定不惜一切代价阻止他。更令人意外的是，这个天劫的真面目竟然是坠入岩浆的镐天，不仅如此，他还带着魔焱残留的力量，准备再次卷土重来，让混沌力量及黑暗吞噬这个世界。为了荣誉，更为了世界的和平，泰羽和GOGO战队再次肩负重任，站在了拥有无限力量的混沌巨神镐天的面前。
在宇宙深处，邪恶的黑魔王复活了。为了完成称霸宇宙的邪恶欲望，黑魔王派出爪牙小黑怪，四处收集一种称为“精神之光”的能量，将魔爪伸向了地球。小黑怪无意中吸取了文字的源头-石壁绘画的精神之光，导致整个中华文明的文字发展停滞，正常的时间流逐渐崩溃。星猫和12星座战士为了让历史的时间流回归正常，再次穿越到了古代，围绕中国的文字书法展开了神奇的冒险。
三只小猪驾着自己的飞船，踏上了前往“甜甜圈星球”的旅途。不料飞船遇到白洞的喷射，坠落在冰冻星球，偶遇人造外星人豆豆，并和豆豆成为了好朋友。但他们在护送豆豆回家的途中遇到了邪恶博士，并被告知豆豆是“四十大盗”。豆豆究竟是好人还是坏蛋？正义博士究竟在哪里？三只小猪面临的，是一场需要拯救宇宙的大冒险！
