神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
十方天域，强者为尊，少年林天被未婚妻萧韵联合莫家长子莫森骗光了家产，还被推下悬崖。侥幸未死的他终于幡然醒悟，决心向两家复仇，夺回属于自己的一切，在悬崖之下，他偶获神秘黑铁剑，此剑暗藏神功，竟助他炼成无上武道。因实力不足，他决定先拜入九阳武府，待实力成熟后再行复仇，不料武府长老却是莫森的大伯，林天内外交困，危机重重。林天开始低调行事，苦修武道，精修符阵之法，暗中出城历练，战赤面鬼，杀百足兽，夺血魂花，奇遇不断。他的实力飞速增长，萧莫两家却仍不知悔改，埋伏、暗杀，甚至发动全家势力进山围剿，而林天神功大成，自以一剑破之。且看少年林天如何喋血复仇，历经磨难，终成神王，一统十方之天界！
凹凸世界的创世神是一位很肆意随性的神明。他创造了凹凸世界的无数星球和人民，又随心所欲毫无规律地统治着他们——他让有的星球富饶美丽，让有的星球贫瘠荒凉，让有的子民享受自由幸福，又让有的子民承担重税苦役。创世神设立了七神使，让他们代自己推行神的旨意但是，创世神也不是完全不给 他的子民机会——如果有谁想改变自己的命运，实现自己的愿望，那么就去参加“凹凸大赛”吧！参赛者将得到大赛系统赐予的“特殊能力”，并锻炼运用各自的能力不断闯关战斗。只要能在凹凸大赛中获得最终的胜利，那么就能得到一切，并赐予你与“七神使”一样代神统治世界的权力。然而，这些都只是虚伪的表象……
超迷你战士与超超迷你战士通力合作，利用加减乘除的力量将所有烦恼星人全部变回烦恼蛋。但新的烦恼星人“恶果大王”就此登场，想女皇和萌的乱来之力让超迷你战士和烦恼星人频繁变人。另一边，疯癫的旋女贝比又来捣乱，超麻烦战士又惹出了大麻烦。正能量的女娃博士率领超迷你战士和超超迷你战士齐心协力打败烦恼和麻烦，拯救人类。
短片集由八个植根于中国传统文化的独立的故事组成：《小妖怪的夏天》《鹅鹅鹅》《林林》《乡村巴士带走了王孩儿和神仙》《小满》《玉兔》《小卖部》《飞鸟与鱼》，在观众面前铺陈开一个极具中式想象力和审美魅力的“妖怪”故事集。 其中故事纵览古今、展望未来，从古代故事到科幻想象、 从乡土眷恋到唯美爱情、从生命母题到人性思考，展现着中式想象力、承载着中国民族文化与哲学。影片涵盖多种美术风格以及制作手法：既有传统的二维、剪纸、偶定格动画，又有CG、三渲二的现代技术，还有将素描与中国水墨韵味相结合的创新尝试，是创作者们对中国美学一次多视角的诠释。
异人再度集结，哪都通全新任务开启！甲申之乱到底隐藏怎样的真相？二十四节谷危机重重，一口气半年番，冒险即将展开，敬请期待！
马诺、丁凯和兰欣儿在丛林里告别大家后搭乘直升机回家，途中突遇火山爆发，飞机迫降在爪哇岛丛林中，大家决定寻找失散的马诺，开启新的火山冒险旅程。
千年前，神将飞蓬与魔尊重楼于新仙界中大战，神剑“照胆”跌落人间，飞蓬被贬下凡。千年后，蜀山锁妖塔震荡，获得魔剑的飞蓬转世——景天，与唐雪见、徐长卿及紫萱几人开始了一场为收集五灵珠封印锁妖塔的冒险。
